Acredito que encontrei a resposta:
Um bom utilitário perl chamado exiftool que eu estava planejando usar para obter dados exif em uma ampla variedade de arquivos de mídia. Acontece que tem um sistema de classificação de diretório
Algo ao longo das linhas deste comando é a resposta:
exiftool -r -d %Y/%m/%d/image_%H%M%S.%%e "-filename<filemodifydate" DIR
home page do exiftool: link