Essas mensagens são normalmente devidas a falhas durante o download da lista ou a uma falha no espelho. Você pode corrigi-lo removendo as listas com falhas:
$ sudo rm /var/lib/apt/lists/partial/archive.ubuntu.com_ubuntu_dists_saucy_universe_binary-amd64_Package
e atualizando com sudo apt-get update
. Se ainda acontecer, use outro espelho ou espere um pouco antes.