Aparentemente, o disco é particionado usando o layout da GPT, necessário se o sistema usar o UEFI para inicializar. Talvez o FreeBSD investigue primeiro o antigo layout de particionamento do MS-DOS, filtre e imprima uma mensagem sobre isso, mas continue experimentando outros layouts e encontre com êxito o layout da GPT e continue a inicialização.
No que diz respeito a escolher o SSD manualmente, isso provavelmente é apenas um problema de configuração do BIOS. Eu suspeito que o disco rígido está conectado à primeira porta SATA e, portanto, torna-se o disco de inicialização padrão. Corrija a configuração do BIOS ou troque as conexões SATA para que o SSD esteja agora conectado à primeira porta SATA.