Se você quiser depender da versão, use isto:
if version > 700
"do stuff for version 7 and up
endif
Se o que você realmente quer saber é se um certo comando funciona, você pode usar a instrução exists
:
if exists('+breakindent')
set breakindent
endif
Se estiver em uma interface gráfica de que você gosta, tente if has('gui_running')
ou coloque os comandos em .gvimrc
.