Você tem a tecla Alt correta (código de chave 0x6c) configurada para enviar o modificador mod1 , igual à tecla Alt Alt . A tecla direita Alt envia o Alt_R keysym. Isso significa que sua tecla direita Alt é uma tecla Alt, não uma tecla AltGr. Para tornar a chave uma chave AltGr, você precisa enviar o Mode_switch keysym e um modificador separado. (Se as atribuições keysym e a atribuição do modificador forem inconsistentes, alguns aplicativos usarão uma configuração, alguns usarão a outra e alguns se comportarão de maneira estranha.)
Coloque essas linhas em ~/.Xmodmap e organize para executar xmodmap ~/.Xmodmap quando você efetuar login. Não tenho certeza sobre o efeito de ISO_Level3_Shift (usado para alternar entre layouts) sendo atribuído ao mesmo modificador; Se isso for um problema, coloque isso e Mod_switch em diferentes modificadores.
keycode 108 = Mode_switch
add Mod5 = Mode_switch
Se você alterar as atribuições de modificadores durante uma sessão, alguns aplicativos precisarão ser reiniciados; Eu não sei se esse é o caso do i3wm.