O Tomcat gira seus próprios arquivos de registro : por padrão, pelo menos, localhost_access_log_ (configurado usando AccessLogValve em server.xml , procure em /opt/alfresco/tomcat/conf ) e os arquivos de log configurados usando FileHandler em logging.properties ( catalina.out e assim por diante).
Não tenho certeza de como você faria para compactar os arquivos de log nativamente na estrutura de criação de log do Tomcat, além de adicionar seu próprio manipulador ...