Quanto a Fedora , os dois métodos funcionarão, não há garantia de escolher qual deles é preferível.
Para Redhat/Centos , você deve usar /etc/sysconfig/modules , desde quando está documentado em Documentação Redhat - Carregamento de módulo persistente .
Outra maneira de usar o /etc/modules.conf em Redhat/Centos base distro. Se você usar Debian base distro, use o arquivo /etc/modules em vez disso.