(Não posso aceitar minha própria resposta ainda, nem infelizmente eu posso favem Faheem para o ponteiro devido a baixa reputação - quando possível)
Faheem Mitha apontou-me na direção certa, mencionando as listas de discussão. Eu os procurei e descobri que eu não sabia como o Debian inicializa:
o arquivo initrd.gz é onde todas as coisas estão, que são carregadas como o sistema base. Para abri-lo, você precisa usar gzip (obviamente) e cpio .
Na verdade, aqui está todo o procedimento lol: P
Eu me vinculei a isso no OP, mas achei que tinha a ver com a pré-configuração e não tinha ideia de onde procurar modificar o sistema base de qualquer maneira. Quando descobri que o arquivo initrd era o que eu precisava mudar, essas instruções faziam muito mais sentido: P
Seguindo as instruções, você pode obter o sistema de arquivos base, substituir ou alterar o que quiser (no meu caso eu simplesmente instalei manualmente alguns debs onde eles queriam estar) e então remontar o initrd corretamente, colocá-lo de volta de onde você tirou e reconstruiu o arquivo iso.
Lembre-se, há um initrd.gz para o instalador gráfico e não gráfico separadamente!