Verifique se você tem o TRIM habilitado para o seu SSD no OS X. Eu uso o link e notei uma velocidade considerável aumentar depois de instalá-lo e reinicializar com o suporte ativado.
Tente isso e poste de volta se isso ajudar suas velocidades de E / S.
Além disso, ele é criptografado na máquina Linux? A criptografia fornecerá alguma sobrecarga.