Para reparar seu espaço pessoal, execute:
$ sudo chown -R $USER:$USER ~/
Para qualquer um dos outros aplicativos que estão quebrados, você terá que repará-los, pois há um problema com um aplicativo. A maioria dos arquivos do sistema é de propriedade do root e a maioria ainda funcionará.
Certos serviços, como Mysql e Apache , são de propriedade de um usuário específico ... no caso de Mysql , o usuário é mysql . No caso de Apache , o usuário padrão é www-data .
Existem outros programas do servidor que você pode executar, como Ftp . O usuário padrão do Ftp server é ftp .
Se um aplicativo estiver corrompido, é mais provável que ocorra um erro que sugira um problema com a permissão.