TL; DR Quase qualquer software de edição de áudio popular no Linux suporta isso.
A maioria dos editores de áudio, seqüenciadores e DAWs completos do Linux suportam VST e MIDI, como LMMS , Ardour , Audacity , etc.
Há também alguns sintetizadores de software dedicados que normalmente recebem MIDI, mas acredito que apenas o Fluidsynth suporte o VST.
Há também um punhado de softwares de música (geralmente chamados de editores MIDI) no Linux que suportam MIDI, mas raramente suportam VST, mas basicamente qualquer DAW completo no linux suporta VST, assim como outros sistemas de plugins como o LV2.
Eu normalmente fugiria de uma pergunta como essa, considerando que ela mudaria com o tempo, mas o que eu mencionei aqui é verdade sobre o Linux desde que comecei a usá-lo há uma década e foi uma das primeiras coisas Eu fiz no Linux.