Sim, você pode instalar o centos na unidade USB. Não o instale no mesmo disco USB que você está usando como instalador. Use um disco usb separado como instalador e instalação. Ou você pode manter o instalador em um disco de CD.
Selecione a unidade de inicialização corretamente ao usar o CentOS instalado no usb. Você pode instalar o bootloader na unidade usb para torná-lo inicializável e selecioná-lo como a primeira unidade de inicialização. Caso contrário, pule a instalação do bootloader na unidade usb e faça um pedido adequado na configuração do grub do seu sistema Linux existente no disco rígido
O procedimento de instalação é o mesmo que instalar no disco rígido. É melhor instalar em um drive USB 3 para um melhor desempenho.