Você precisa reconstruir os pacotes para a nova versão ocaml ou espere até que o Debian o faça oficialmente.
Para reconstrução, por ex. siga este tutorial geral: link
Já existe uma transição no Debian em andamento, onde todos os OCaml pacotes são reconstruídos automaticamente para a nova versão do OCaml. Você pode encontrar detalhes sobre isso e problemas relacionados no sistema de acompanhamento de bugs . Recriar pacotes para a arquitetura amd64 pode ser encontrado já aqui.