Instalei o Bodhi no Virtual Box 4.2.6 com as Extensões do VirtualBox correspondentes.
Como você não tem o /etc/init.d/vboxadd, então eu acho que você está usando o Virtual Box 4.1 ou anterior. Ou atualizar o VirtualBox para 4.2.6 ou talvez você esteja faltando as extensões do VirtualBox para a sua versão instalada Vou colocar os passos que realizei de acordo com o VirtualBox 4.2.6
mount /dev/cdrom
cd /cdrom; ./VBoxLinuxAdditions.run
durante este processo ele irá reclamar sobre o gcc não encontrado
apt-get update
apt-get install gcc
/etc/init.t/vboxadd setup
Depois disso, reinicie o X e ele estará funcionando.