Para ver quais threads estão rodando no mysql, no Linux:
root@myserver:~> mysqladmin processlist
A consulta mysql equivalente a isso seria:
root@myserver:~> mysql
mysql> SHOW FULL PROCESSLIST\G
Além disso, confira Como examinar informações de tópicos para ver o que os meios de saída . Mais notavelmente:
Command and State indicate what the thread is doing.
Most states correspond to very quick operations. If a thread stays in a given state for many seconds, there might be a problem that needs to be investigated.
O ponto principal é olhar para a lista de processos do mysql e ver se algo lhe parece suspeito, dada a natureza do seu ambiente, por ex. processos de longa duração ou grande número de processos.