Execute o tripwire como um trabalho noturno.
Como alternativa, coloque todo o sistema sob controle de versão. Execute o comando diff
da ferramenta de controle de versão para ver as alterações e seu comando revert (no entanto, é chamado) para reverter quaisquer alterações na cópia local. Observe que a maioria dos sistemas de controle de versão manipula o conteúdo do arquivo, mas exige trabalho extra para metadados, como permissões.
Como alternativa, use um sistema de armazenamento com alguma forma de suporte a snapshot, como LVM ou máquinas virtuais.
Como alternativa, por que não evitar todas as alterações?