Como Stephen Kitt apontou, o seguinte só funciona corretamente se houver zero ou um diretório correspondente. Se houver mais, o glob corresponderá a todos eles, e você acabará movendo o arquivo e todos menos o último diretório para o último diretório correspondente. Tome cuidado.
Quando o shell vê um asterisco (ou um ponto de interrogação), ele tenta encontrar um caminho que corresponda à expressão. Desde que você incluiu "myfile.txt" no final do caminho, o shell irá procurá-lo e, se não encontrá-lo, a correspondência falhará.
Portanto, para mover esse arquivo para esse diretório, use:
mv ~/Downloads/myfile.txt ~/.config/foldername/*.dev-edition/subfolder/
(ou seja, apenas omitir o nome do arquivo.)
Se você quiser mover o arquivo e alterar seu nome, faça isso em duas etapas:
mv ~/Downloads/myfile.txt ~/Downloads/newname.txt
mv ~/Downloads/newname.txt ~/.config/foldername/*.dev-edition/subfolder/