Se você tiver uma versão recente do rsync (pelo menos 2.6.7), poderá usar reggi.com/assets/dailybooth/img/original/***
em list.txt
e assim por diante. Então ambos os seus comandos irão funcionar. Eu não acho que haja um jeito menos desajeitado. Você pode querer adicionar --prune-empty-dirs
ao primeiro comando.
Eu questiono seu fluxo de trabalho geral. É bastante estranho copiar diretórios específicos em uma direção e o resto na outra direção. Recomendo organizar conteúdo idêntico em ambos os lados e executar a sincronização bidirecional sempre que você fizer uma alteração em qualquer um dos lados. A ferramenta escolhida para a sincronização bidirecional é Unison .