Parece que agora você pode, copiar seu arquivo xml em algum lugar, dizer ao virsh para usá-lo:
virsh define ~/vm.xml
e comente o que você quer.
Quando você iniciar o vm, o virsh fará uma cópia do arquivo em /etc/libvirt
, removerá os comentários e iniciará o vm, não tocando o arquivo xml original /etc/libvirt
.