Você pode usar a tecla Shift junto com as teclas de seta para navegar pelo Nautilus.
Shift + ← fecha um diretório desdobrado (mas não sobe na árvore)
Shift + → abre um diretório dobrado (mas não entra)
Usar Alt com as teclas de seta para a esquerda e para a direita percorre o histórico de diretórios acessados, mas não faz nenhum dobramento / desdobramento da árvore (e está sempre me confundindo).