por que não instalar apenas uma distro leve diretamente em um pendrive? Minha solução para esse problema é ter uma instalação normal do Crunchbang #! na minha chave USB, que eu posso atualizar, ajustar, instalar ferramentas extras, scripts pessoais etc. para, e assim por diante. Funciona um deleite! Você poderia usar qualquer distro que você quiser, é claro. O Crunchbang é uma boa escolha, mas você provavelmente terá suas próprias preferências.