A causa do problema foi que a desconexão usb foi um sucesso parcial, idealmente deveria ser assim no dmesg.
[2759033.084067] ehci-pci 0000:00:1a.0: remove, state 4
[2759033.084080] usb usb1: USB disconnect, device number 1
[2759033.084082] usb 1-1: USB disconnect, device number 2
[2759033.088425] ehci-pci 0000:00:1a.0: USB bus 1 deregistered
[2759054.553007] ehci-pci 0000:00:1d.0: remove, state 1
[2759054.553018] usb usb2: USB disconnect, device number 1
[2759054.553020] usb 2-1: USB disconnect, device number 2
[2759054.553022] usb 2-1.5: USB disconnect, device number 3
A solução foi modificar o sysstat para impedir que o USB causasse o problema.
DE:
180:ub:*:0:a:32:p:8:USB block devices
PARA:
#180:ub:*:0:a:32:p:8:USB block devices
Em seguida, reinicie o serviço sysstat.
systemctl restart sysstat.service