Assim, um colega experimentou o suporte a páginas grandes e não reverteu todas as alterações efetuadas. Quando eu corri
sysctl -w vm.nr_hugepages=0
e comentou esta seção no /etc/sysctl.conf
# Hugepage Support MySQL
#vm.hugetlb_shm_group = 27
#kernel.shmmax = 10737418240
#kernel.shmall = 23689185
#vm.nr_hugepages = 46268
liberou 90 GB que foram desperdiçados. Isso pode ser visto na saída de cat /proc/meminfo
:
HugePages_Total: 46268
HugePages_Free: 46268
HugePages_Rsvd: 0
HugePages_Surp: 0
Hugepagesize: 2048 kB
Muito obrigado a Matthew Ife. Por favor, vote sua resposta no serverfault.com ao invés desta.