A unidade do Linux não está sendo lida em nenhum lugar

Question

Eu instalei o Manjaro Linux no meu novo SSD de 128GB M.2. Tudo estava funcionando bem por uma semana ou mais. Eu estava, então, excluindo alguns arquivos grandes (4 GB) de outro disco rígido de 2 TB. Cada uma dessas exclusões levou cerca de um minuto, e meu computador ficou muito lento e lento ao executar as exclusões, o que me surpreendeu, pois ele também tem 8GB de RAM e um processador i3. Como eu deletei cada arquivo, eles foram colocados na minha lixeira, que eu presumo que está armazenado no SSD do Linux - então esses arquivos foram basicamente transferidos do HDD para o SSD quando eu pressionei "Mover para o lixo". Um por um, eu apaguei todos os 7 desses arquivos grandes e depois de cada um eu esvaziei a lixeira (apaguei o arquivo da pasta Lixeira no SSD do Linux).

Decidi então reiniciar quando todos os 7 arquivos foram completamente excluídos. Grub de repente mostrou, na reinicialização, que não havia drive inicializável. Não reconheceria minha instalação do Manjaro Linux. Agora eu sou iniciado no USB inicializável que usei há uma semana para instalar o Manjaro. Meu disco rígido está desconectado e o SSD ainda está conectado. A única unidade / partição exibida no Gparted e com fdisk -l é o USB.

Alguma idéia do que poderia estar causando isso ou como posso resolvê-lo? Eu não tenho nenhum problema em fazer uma limpeza completa e instalar novamente no SSD - todos os meus dados importantes estão no disco rígido desconectado.

Editar:

[manjaro@manjaro ~]$ sudo hdparm -I $(ls /dev/sd?)

/dev/sda:
SG_IO: bad/missing sense data, sb[]:  70 00 05 00 00 00 00 0a 00 00 00 00 20 00 00 00 00 00 00 00 00 00 00 00 00 00 00 00 00 00 00 00

ATA device, with non-removable media
Standards:
        Likely used: 1
Configuration:
        Logical         max     current
        cylinders       0       0
        heads           0       0
        sectors/track   0       0
        --
        Logical/Physical Sector size:           512 bytes
        device size with M = 1024*1024:           0 MBytes
        device size with M = 1000*1000:           0 MBytes 
        cache/buffer size  = unknown
Capabilities:
        IORDY not likely
        Cannot perform double-word IO
        R/W multiple sector transfer: not supported
        DMA: not supported
        PIO: pio0 

Editar 2:

[manjaro@manjaro ~]$ lsblk
NAME   MAJ:MIN RM   SIZE RO TYPE MOUNTPOINT
loop0    7:0    0    10M  1 loop /run/miso/sfs/livefs
loop1    7:1    0 224.4M  1 loop /run/miso/sfs/mhwdfs
loop2    7:2    0   1.3G  1 loop /run/miso/sfs/desktopfs
loop3    7:3    0 371.8M  1 loop /run/miso/sfs/rootfs
sda      8:0    1  14.5G  0 disk 
└─sda1   8:1    1  14.5G  0 part /run/miso/bootmnt
[manjaro@manjaro ~]$ blkid
/dev/sda1: LABEL="MJRO170R" UUID="7490-2820" TYPE="vfat" PARTUUID="18f73e82-01"
/dev/loop0: TYPE="squashfs"
/dev/loop1: TYPE="squashfs"
/dev/loop2: TYPE="squashfs"
/dev/loop3: TYPE="squashfs"
[manjaro@manjaro ~]$ lspci
00:00.0 Host bridge: Intel Corporation Device 5904 (rev 02)
00:02.0 VGA compatible controller: Intel Corporation Device 5916 (rev 02)
00:08.0 System peripheral: Intel Corporation Skylake Gaussian Mixture Model
00:14.0 USB controller: Intel Corporation Sunrise Point-LP USB 3.0 xHCI Controller (rev 21)
00:14.2 Signal processing controller: Intel Corporation Sunrise Point-LP Thermal subsystem (rev 21)
00:16.0 Communication controller: Intel Corporation Sunrise Point-LP CSME HECI #1 (rev 21)
00:17.0 SATA controller: Intel Corporation Sunrise Point-LP SATA Controller [AHCI mode] (rev 21)
00:1c.0 PCI bridge: Intel Corporation Device 9d10 (rev f1)
00:1c.5 PCI bridge: Intel Corporation Sunrise Point-LP PCI Express Root Port #6 (rev f1)
00:1c.7 PCI bridge: Intel Corporation Sunrise Point-LP PCI Express Root Port #8 (rev f1)
00:1d.0 PCI bridge: Intel Corporation Sunrise Point-LP PCI Express Root Port #9 (rev f1)
00:1f.0 ISA bridge: Intel Corporation Device 9d4e (rev 21)
00:1f.2 Memory controller: Intel Corporation Sunrise Point-LP PMC (rev 21)
00:1f.3 Multimedia audio controller: Intel Corporation Device 9d71 (rev 21)
00:1f.4 SMBus: Intel Corporation Sunrise Point-LP SMBus (rev 21)
00:1f.6 Ethernet controller: Intel Corporation Ethernet Connection (4) I219-V (rev 21)
3a:00.0 Network controller: Intel Corporation Device 24fd (rev 78)
3b:00.0 Unassigned class [ff00]: Realtek Semiconductor Co., Ltd. RTS5229 PCI Express Card Reader (rev 01)
3c:00.0 Non-Volatile memory controller: Intel Corporation Device f1a5 (rev 03)

É um SSD PCIe M.2 Intel de 128GB, por isso acredito que seja o último dispositivo listado no endereço 3c: 00.0.

Também entrei no BIOS e percebi que o SSD é reconhecido e meu modelo exato está listado em Dispositivos > SATA > NVMe M.2 SSD.

EDIT 3:

Saída do dmesg na inicialização