Uma maneira garantida de fazer isso é usar o BIT 4 BIT Cloning. Isso faz com que uma imagem tenha o mesmo tamanho exato dessa unidade, mas deve garantir que o seu novo pen drive funcione da mesma maneira.
Quando você chegar na primeira tela do Clonezilla
Escolha Dev-Disk não Dev-part / image.
Isso leva mais tempo e mais espaço, é claro, mas com um pen drive, não imagino que leve horas.
(Eu fiz discos de 500 GB em cerca de 3/4 horas via USB.)
O Clonezilla não entende as partições Windows, assim como o Linux, então se você tem um sistema dual boot em um pen drive de 16GB você não especifica o tamanho , então este provavelmente seria o caminho ir. (Especialmente se for apenas para uso pequeno / uso doméstico, etc, se você estivesse implantando em 100 computadores, você pode querer dedicar um tempo para aprender os detalhes do clonezilla)
A única maneira de aprender é fazer um teste HD realmente e testar. (Mas é possível 100%)
Nenhum plano de backup é bom, a menos que você tenha testado a restauração do backup!