Na verdade, há um cenário comum que fiz muitas vezes quando você desmontava o sistema de arquivos e o montava de outra instalação do sistema operacional. É chamado de "recuperação".
Sempre que você fizer a recuperação, inicialize, por exemplo, a partir do sistema operacional em seu CD ou de outra instalação do computador e faça alterações no sistema de arquivos. Você desmonta e inicializa a partir do sistema operacional original e tudo funciona corretamente.
Este cenário é algo como a tarefa de manutenção padrão que eu (e provavelmente todo administrador de Linux experiente) fez dezenas de vezes sem problemas.
Além disso, você pode, por exemplo, montar uma unidade USB em um computador, desmontá-lo e montá-lo em outro computador sem problemas também.
Claro que também há algumas notas no sistema de arquivos. Não depende de uma instalação específica, mas armazena atributos importantes do FS como "opções de montagem, estado do sistema de arquivos - clean, etc ...".
Você pode ler sobre esses atributos quando ligar
man tune2fs
Eu não ficaria muito preocupado com a situação quando você desmontar corretamente o sistema de arquivos e montá-lo em SO diferente, tanto quanto eu estaria preocupado com o mecanismo de bloqueio correto, etc ... Sistema de arquivos Ext3 / 4 não é criado para uso de clustering e Eu não entendo porque você está tentando fazer isso.
Existe alternativa OCFS2 (Oracle Cluster File System 2) que é livre, de código aberto e no kernel do Linux especificamente criado para este tipo de situações. Eu não vejo razões para não usar o OCFS2 e em vez disso, faça um sistema de bloqueio self-made (leia-se "com bugs desconhecidos") quando puder usar uma solução testada e livre.