Se você quiser que a coluna 3 seja exatamente '1', então:
awk '$3==1' input > output
Se você quiser que a coluna 3 contenha '1', então:
awk '$3~1' input > output
Caso você prefira sed, aqui está uma para "coluna 3 é exatamente 1":
sed -rn '/^[^ ]*[ ]*[^ ]*[ ]+1$/ p' input > output
... e sed para "coluna 3 contém 1":
sed -rn '/^[^ ]*[ ]*[^ ]*[ ]+.*1.*$/ p'