Pelo menos com o Linux / procps top, você provavelmente desejará -b (para alternar para o modo batch) e -n 1 (para executar apenas uma iteração).
top -b -n 1
Sugiro ler a página de manual via man top , ele documenta essas opções.
Sem mencionar que, dependendo da meta, pode haver ferramentas melhores para usar (por exemplo, ps ou alguma biblioteca disponível em sua linguagem de programação).