Você pode configurar o Xorg para desabilitar o OpenGL / GLX.
Para uma primeira tentativa, você pode executar uma segunda sessão X: mude para tty2, faça o login e digite:
startx -- :2 vt2 -extension GLX
Para desabilitar permanentemente a aceleração de hardware, crie um arquivo:
/etc/X11/xorg.conf.d/disable-gpu.conf
com o conteúdo:
Section "Extensions"
Option "GLX" "Disable"
EndSection
Note que os compositores do Xwayland em Wayland como o Gnome3-Wayland irão ignorar as configurações em xorg.conf.d
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