O Nano não armazena as opções compiladas conforme fornecido na linha de comando ./configure , ele as reconstrói com base nos recursos detectados e no alvo solicitado (Nano "pequeno" ou Nano normal). Para o minúsculo Nano, ele informa opções ativadas, já que elas adicionam ao padrão; para o Nano normal, ele relata as opções desativadas, já que elas são removidas do padrão (na maioria dos casos).
No seu caso, você está construindo o Nano normal, portanto, para a maioria das opções só informa se eles estão desativados ; as exceções são debug , utf8 e slang . Todas as suas opções --enable são padrões para o Nano normal, por isso não as reporta nas opções compiladas; você obteria o mesmo resultado com ./configure e sem opções. Você acaba com --disable-magic porque você não tem os arquivos de desenvolvimento para libmagic (veja a resposta de Thomas Dickey ), e com --enable-utf8 , porque você tem os recursos necessários para o suporte a UTF-8 (e está ativado por padrão).