Para o exemplo simples que você mostra onde há apenas um sublinhado e que está no segundo e no último campo, você pode fazer:
$ sed 's/_\(.*\)/& /' file | tr ' ' '\t'
2 1_123 123
2 2_345 345
Ou, se a sua implementação sed suportar expressões regulares estendidas:
$ sed -E 's/_(.*)/& /' file | tr ' ' '\t'
2 1_123 123
2 2_345 345
Isso corresponderá ao primeiro _ e tudo depois disso. Os parênteses capturam a string combinada e podemos nos referir a ela na mão direita da substituição como . & é tudo o que foi correspondido, então o _ seguido pelo restante do segundo campo. A substituição, portanto, será impressa, um espaço e os caracteres após o _ . O tr substitui todos os espaços por tabulações.
Para casos mais complexos, em que você pode ter um número arbitrário de campos e qualquer um deles pode conter _ , você pode usar perl :
$ perl -lane 's/ +/\t/g; $F[1]=~/_(\S+)/; print "$_\t$1"' file
2 1_123 123
2 2_345 345
O -a faz com que perl divida sua entrada no espaço em branco na matriz @F . O segundo campo é $F[1] porque as matrizes começam a contar em 0 . O -n significa "leia o arquivo de entrada linha a linha e aplique o script fornecido por -e ". O -l remove as novas linhas à direita da linha de entrada e adiciona uma nova linha a cada chamada print .
s/ +/\t/g; substitui todas as ocorrências de um ou mais espaços por tabulações, $F[1]=~/_(\S+)/; corresponde aos caracteres após o _ no segundo campo e os salva como $1 e o print "$_\t$1" imprimirá a linha atual ( $_ ) seguido pelo que quer que tenha sido correspondido.
Outra ferramenta útil para dados baseados em campo é awk :
$ awk '{gsub(/ /,"\t");l=$2; sub(/.*_/,"",l); print $0"\t"l}' file
2 1_123 123
2 2_345 345
Em awk , as linhas de entrada são divididas automaticamente no espaço em branco e se tornam $1 m $2 ... $N . O gsub(/ */,"\t"); substitui todos os espaços por tabulações; l=$2 salva o segundo campo como l ; sub(/.*_/,"",l); remove tudo até e incluindo o _ de l ; e print $0"\t"l imprime a linha ( $0 ) seguida por uma tabulação e o segundo campo modificado.