Ele está completamente errado. O número de série faz parte da zona; não é mais único entre zonas separadas do que qualquer outro registro.
RFC 1035 , seção 5, afirma isso claramente:
SERIAL The unsigned 32 bit version number of the original copy
of the zone. Zone transfers preserve this value. This
value wraps and should be compared using sequence space
arithmetic.
Diz a zona , não "a totalidade de todas as zonas no servidor".
Como você está executando o ISC BIND, você também pode pedir a ele que mostre onde o Bind Administrator's Manual diz que nenhum arquivo de zona no servidor pode ter o mesmo número de série. (Spoiler: Nowhere.)