Você pode usar a variável de ambiente DEBIAN_FRONTEND
.
DEBIAN_FRONTEND=noninteractive aptitude -y install mysql-server > /dev/null 2>&1
ou se você executar mais de uma instalação, talvez queira adicionar uma exportação ao topo do seu script
export DEBIAN_FRONTEND=noninteractive
aptitude -y install mysql-server > /dev/null 2>&1