Se não importa onde na lista de opções o novo vai, você poderia
sed '/_configure_flags *:=/ a\
--add-module=$(MODULESDIR)/ngx_pagespeed \
' file
light_configure_flags := \
--add-module=$(MODULESDIR)/ngx_pagespeed \
$(common_configure_flags) \
--with-http_gzip_static_module \
...
Para adicionar após a linha "common_configure_flags", você pode:
sed -r '
# when the line ends with a backslash
# add the new line with a backslash
/\$\(common_configure_flags\)[[:blank:]]*\$/ a\
--add-module=$(MODULESDIR)/ngx_pagespeed \
# when the line does not end with a backslash,
# add a backslash, then
# add the new line without a backslash
/\$\(common_configure_flags\)[[:blank:]]*$/ {
s/$/ \/
a\
--add-module=$(MODULESDIR)/ngx_pagespeed
}
' file