Você pode apenas listar os diretórios que deseja observar:
$ inotifywait testdir1 testdir2/ -m
Dentro da aplicação, depois que a instância do inotify é criada usando a função inotify_init () , inotify_add_watch () pode ser chamado várias vezes para caminhos selecionados. Você pode encontrar o limite do sistema para observar caminhos em /proc/sys/fs/inotify/max_user_watches
(8192 por padrão).