Isso parece um problema do NFS. O NFS está envolvido?
Os servidores NFS em execução nos sistemas baseados em Debian e, possivelmente, em outros, são configurados para ignorar grupos suplementares, a menos que seja explicitamente informado o contrário. Assegure-se de que --manage-gids tenha sido fornecido para o programa rpc.mountd . Nos sistemas Debian, isso é feito editando /etc/default/nfs-kernel-server e garantindo que RPCMOUNTDOPTS=--manage-gids esteja presente.