Eles mudaram o local para / var / www / html no apache2.4, de modo que um pouco de texto no index.html esteja apenas informando a alteração. Você não precisa alterar a raiz do documento.
Se você quiser criar um novo host virtual basta adicionar um novo_website.conf ao / etc / apache / sites-available e especificar o local desejado (para criar o symlink na pasta habilitada para sites use a2ensite). Como regra geral, fazer um novo local em / var / www / html / new_website seria bom (ou qualquer outro local que você preferir que o usuário do apache possa acessar).
Você não deve precisar adulterar o apache2.conf para um site normal. Principal alteração entre o apache 2.2 e o apache 2.4 que parece atrapalhar as pessoas, é necessário garantir que você use uma extensão de .conf para o seu novo arquivo conf do host virtual. No apache anterior 2.2 não importava.