Você não precisa dos nomes para ser citado, você precisa que as variáveis sejam citadas. Especificamente, para fazer seu script funcionar, você precisa substituir o for folder in ...
loop por:
/tmp/IMAPdedup-master/imapdedup.py -s "$SERVER" -x -u "$USER" -w "$PASS" -l |
while IFS= read -r folder; do
/tmp/IMAPdedup-master/imapdedup.py -s "$SERVER" -x -u "$USER" -w "$PASS" "$folder"
done
Sugiro que leia as seguintes mensagens para entender o motivo: