Sim, você pode fazer isso com grep
:
printf %s\n {a..z} | grep -vf infile
ou com sort
/ join
e um shell moderno:
sort -u infile | join -v2 - <(printf %s\n {a..z})
ou, da mesma forma, com awk
:
awk 'NR==FNR{z[$0]++;next}!($0 in z)' infile <(printf %s\n {a..z})