Algo está quebrando sua conexão de rede. Pode ser qualquer dispositivo de rede entre a máquina local e a máquina remota. Por exemplo, alguns firewalls sobrecarregados tendem a eliminar conexões de maneira um tanto aleatória. Diagnosticar isso requer um bom conhecimento da topologia da rede.
As conexões Rsync são mais fáceis de retomar quando a conexão TCP subjacente cai: basta executá-lo novamente. Desde que cada execução tenha tempo para transferir pelo menos um arquivo completo, ele terminará o trabalho eventualmente.
Em geral, você pode construir uma conexão TCP mais confiável sobre uma menos confiável, mas não conheço nenhuma solução pronta. Alguns softwares de VPN podem funcionar bem para isso. Rocks é uma ferramenta antiga e sem manutenção para fazer exatamente isso.
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