Eu não entendo o que você está perguntando, mas por que você não clica duas vezes na palavra / nome do arquivo que deseja usar? quando você clica duas vezes em uma palavra, ela seleciona a palavra inteira. Você pode configurar quebras assim como. ou, ou < ou (vai parar o duplo clique select. Estes são configuráveis. Eu não tenho putty então eu esqueço como configurar. Google putty doubleclick palavra select.
Em massa, basta clicar duas vezes na palavra / nome do arquivo e colá-la na janela através do método normal de colar. Se você quiser colá-lo de volta em massa, eu acho que é meio clique, talvez clique direito.