Eu não sei exatamente como isso é possível, mas eu tive um problema semelhante.
passo 1: renomear os dispositivos md
etapa 2: atualizar o initramfs
ou passo 2: remova a definição do dispositivo md para o mdadm.conf dentro do initramfs (será sobrescrito na próxima atualização do kernel)
Nota /etc/mdadm/mdadm.conf é usado apenas pelo mdadm. Não por mkinitramfs, não por autodetecção do kernel, nada mais. Nunca testei, mas acho que podemos excluir este arquivo sem qualquer impacto no sistema.
Mas dentro do initramfs, o /etc/mdadm/mdadm.conf é usado para nomear os dispositivos md.
Então você tem que mantê-lo atualizado quando você criar-rebuils-change-delete sua configuração de raid.
Isso é estranho porque a autodetecção do kernel funciona bem.