Na saída de du -ch , a última linha é o total que você pediu com -c , enquanto a segunda à última linha é o tamanho total do diretório que você consultou.
No seu caso de executar du sem um diretório especificado, ele usa . , também conhecido como o diretório atual. O tamanho total de um único diretório consultado geralmente também é o tamanho total. Normalmente, você usaria a opção -c quando quiser que o tamanho total de vários diretórios seja passado para o comando du , ou seja, du -ch /opt /srv /etc
Além disso, a saída de du -ch não mostra tamanhos de arquivos individuais, apenas seus totais no diretório. Sem saber o conteúdo do diretório associado a essa saída, eu diria que você tem 28k de arquivos regulares nessa pasta, bem como esses dois diretórios.