Você pode usar UDF . É meticuloso obter configurações que todos os SOs fiquem felizes em lidar. O format-udf
é uma maneira confiável de acertar os blocos. (Nota: O FreeBSD tem apenas suporte somente para leitura, e somente para versões antigas de UDF)
É amplamente suportado, não possui limitações de tamanho de arquivo do FAT32 ou problemas de patente do exFAT. Suporta permissões no estilo Unix.
O limite de tamanho é 2TiB, a menos que o disco use setores 4K nativos.
O Windows XP pode ler, mas não grava em UDF em discos rígidos. Versões posteriores do Windows têm melhor suporte. (O FreeBSD parece estar ficando para trás com suporte somente leitura, apenas para versões antigas ...)
O FAT32 continua sendo uma opção (seu problema provavelmente é rapidamente corrigido no Gerenciamento de Disco ou corrigindo o byte do tipo de partição (assumindo o MBR)).