Não pertence a nenhum pacote. É um arquivo de configuração que você cria para modificar o comportamento do vinculador dinâmico.
man ld.so fornece os detalhes.
/etc/ld.so.nohwcap
When this file is present the dynamic linker will load the non-optimized version of a library, even if the CPU supports the optimized version.
Embora nenhuma referência seja feita ao arquivo em man ld.so em Jessie (Debian 8), o comportamento não mudou.