A primeira razão que vem à mente é que, como esse é um link absoluto (aponta para /data/git e não ../git ), isso permitirá que ele funcione mesmo se você mover o diretório posteriormente.
Então, diga que você instalou o sistema em /data/git/git e decidiu mover o diretório git final para outro lugar, digamos /foo/bar/git . Agora, o link /foo/bar/git/git continuará funcionando e apontará para /data/git , que pode conter os arquivos de configuração necessários ou o que for.