O IIRC Synaptic marca apenas as coisas que dependem do pacote que você deseja remover. Não aquele do qual o programa depende (que é o que eu chamaria de dependências). Então eu acho que você está errado. kde-multimedia
depende do jogador do dragão e é por isso que é marcado não vv.
Se X e Y dependem de Z, Z não é desinstalado quando X é desinstalado, você precisa fazer apt-get autoremove
para isso.
Mas é fácil tentar e reinstalar quando as coisas quebram (por meio de dependências incorretas).