Use xdotool para encontrar a janela e enviar um evento-chave. Exemplo, assumindo que o 'OpenOffice Impress' está na barra de título desse aplicativo e que está sendo executado em $DISPLAY :0
$ ssh remote-computer
$ export DISPLAY=:0
$ xdotool key --window $(xdotool search --name 'OpenOffice Impress') F5