Muitos programas usam variáveis de ambiente exclusivas de si mesmas. Por exemplo, um programa chamado foo pode procurar uma variável de ambiente chamada FOO_DIR ou FOO_DATA_PATH (e pode usar o diretório atual como padrão se a variável não estiver definida). Eu sei que você disse que não tem fonte, mas tem alguma documentação? Talvez uma amostra .bashrc para usar o programa?
Como último recurso, tente
strings foo
(assumindo que foo é o nome do programa). Isto lista todas as “strings” no arquivo binário (veja strings(1) para detalhes). Isso produzirá muita saída; muito disso sem sentido. Você provavelmente deveria canalizá-lo em um pager; por exemplo, more ou less . Procure linhas que se pareçam com nomes de variáveis de ambiente - isto é, todas em maiúsculas, possivelmente incluindo sublinhados - e tente defini-las no diretório em que você instalou o programa.