Eu não tenho certeza sobre isso, mas se o comando que você quer usar é simples, não interativo, e você só quer digitar coisas nele (e prefixar aqueles com o conteúdo de 'myinput.txt' tente:
cat myinput.txt - | command
ex:
cat myinput.txt - | grep something
Mas se você precisar de interação mais complicada, provavelmente deveria usar expect
(o que não é trivial no início, mas muito poderoso).